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中科曙光中標上海交通大學(xué)醫(yī)學(xué)院附屬瑞金醫(yī)院項目

逾越生命信息學(xué)的“數(shù)據(jù)鴻溝”
2019-07-15 21:05 9035
近期,上海交通大學(xué)醫(yī)學(xué)院附屬瑞金醫(yī)院與中科曙光達成合作,未來將建設(shè)一套符合國際標準、具備技術(shù)先進性的“臨床資源深度分析和挖掘測序模塊計算平臺。

北京2019年7月15日 /美通社/ -- 近期,上海交通大學(xué)醫(yī)學(xué)院附屬瑞金醫(yī)院(以下簡稱“瑞金醫(yī)院”)與中科曙光達成合作,未來將建設(shè)一套符合國際標準、具備技術(shù)先進性的“臨床資源深度分析和挖掘測序模塊計算平臺”(以下簡稱“計算平臺”),通過提升醫(yī)療數(shù)據(jù)檢索、統(tǒng)計分析、圖形化呈現(xiàn)在內(nèi)的大規(guī)模數(shù)據(jù)挖掘能力,支持“轉(zhuǎn)化醫(yī)學(xué)”的醫(yī)療、科研人員進行總結(jié)和探索性的科研工作,讓寫在紙上的論文盡快變成用于臨床的新治療方法,聯(lián)手攻關(guān)危害人類健康的重大疾病。

IT與生物信息融合,解碼“生命信息”

在大數(shù)據(jù)、人工智能和高性能計算逐漸融合的趨勢下,設(shè)計與實現(xiàn)高性能的數(shù)據(jù)解讀學(xué)習模型、算法與軟件,是逾越生命信息學(xué)“數(shù)據(jù)鴻溝”的主要手段。

本次“臨床資源深度分析和挖掘測序模塊計算平臺”的建設(shè)將以患者生理生化指標,器官影像檢查、家族遺傳背景等多維度的數(shù)據(jù)為基礎(chǔ),結(jié)合基因組測序、蛋白質(zhì)組學(xué)和代謝組學(xué)等各種先進組學(xué)檢測等技術(shù),通過生物信息學(xué)手段進行綜合數(shù)據(jù)分析和挖掘,提供與疾病診斷和治療相關(guān)的遺傳和臨床信息。形成特征數(shù)據(jù)后,再通過機器深度學(xué)習和人工智能等方法,實現(xiàn)真正意義上的精準分析、輔助診斷和個性化醫(yī)療。

海量生物數(shù)據(jù)解讀,逾越“數(shù)據(jù)鴻溝”

基因組測序、蛋白質(zhì)組學(xué)、代謝組學(xué)等先進組學(xué)檢測等技術(shù)在生命科學(xué)研究和人類健康領(lǐng)域的應(yīng)用是將生物信息轉(zhuǎn)化為數(shù)字信息,這些數(shù)據(jù)來自于大量的生物樣本、科研中間數(shù)據(jù)和實驗結(jié)果,這些數(shù)字信息如同金礦一樣,等待被挖掘出不可估量的價值。

中科曙光憑借多年在生物基因領(lǐng)域積累的經(jīng)驗,打造生物基因行業(yè)云存儲解決方案。通過Scale-Out橫向擴展、IB+RDMA高速互聯(lián)、內(nèi)核態(tài)POSIX協(xié)議、智能SSD Cache及小文件聚合等技術(shù),消除傳統(tǒng)的Scale-up縱向擴展存儲架構(gòu)的性能局限性,解決生物基因應(yīng)用中對海量大文件存儲場景高聚合帶寬、小文件存儲場景高IOPS的存儲需求。

其次,基因研究產(chǎn)生的數(shù)據(jù)正以每12-18個月10倍的速度快速增長,曙光ParaStor分布式存儲系統(tǒng)可通過性能與容量的線性增長,滿足存儲系統(tǒng)對數(shù)據(jù)處理能力和擴展性的要求,并通過多種技術(shù)手段,從物理底層到邏輯層全方位保證存儲系統(tǒng)高可靠性和高可用性,滿足前端多種基因測序軟件、多種業(yè)務(wù)應(yīng)用的存儲對接需求。

未來,曙光生物基因行業(yè)云存儲解決方案將廣泛運用于生命科學(xué)領(lǐng)域,為廣大客戶的業(yè)務(wù)提供有效的性能保障和技術(shù)支持。

消息來源:中科曙光
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