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諾貝爾獎(jiǎng)“生物信息”解讀,中科曙光助力上海生科院破譯生命密碼

2019-10-14 12:23 5976
近期,曙光成功中標(biāo)上海生科院生物“醫(yī)學(xué)大數(shù)據(jù)設(shè)施-信息系統(tǒng)基礎(chǔ)平臺(tái)”項(xiàng)目,助力上海生科院在生命科學(xué)研究、生物醫(yī)藥研發(fā)、臨床醫(yī)學(xué)研究與應(yīng)用的發(fā)展。

北京2019年10月14日 /美通社/ -- 10月7日,諾貝爾委員會(huì)公布了今年首個(gè)諾貝爾獎(jiǎng):諾貝爾生理學(xué)或醫(yī)學(xué)獎(jiǎng)。獎(jiǎng)項(xiàng)頒發(fā)給三位科學(xué)家,以表彰他們對(duì)于細(xì)胞是怎么感知并適應(yīng)氧氣變化的發(fā)現(xiàn)。在生物科學(xué)領(lǐng)域,近年來還涌現(xiàn)了屠呦呦等諾貝爾獲獎(jiǎng)?wù)撸梢娚锟茖W(xué)在推動(dòng)人類發(fā)展方面的重大意義?,F(xiàn)代生物醫(yī)學(xué)研究需建立在大量實(shí)驗(yàn)樣本、生物樣本、科研中間數(shù)據(jù)的基礎(chǔ)之上,如何破解這些“生命科學(xué)密碼”,為生物研究提供大數(shù)據(jù)支持,成為學(xué)術(shù)界以及生物科學(xué)行業(yè)的關(guān)注點(diǎn)。

IT技術(shù)與生物醫(yī)學(xué)融合,曙光助力上海生科院破譯生命密碼

生物技術(shù)的發(fā)展需要信息技術(shù)提供強(qiáng)有力的計(jì)算工具,借助先進(jìn)的IT技術(shù)解決方案,完成海量實(shí)驗(yàn)數(shù)據(jù)的存儲(chǔ)、讀取與挖掘處理。同時(shí),信息技術(shù)還有助于加強(qiáng)生物技術(shù)領(lǐng)域的各種數(shù)據(jù)庫管理、信息傳遞、檢索和資源共享等。

利用信息技術(shù)對(duì)生物科學(xué)數(shù)據(jù)應(yīng)用領(lǐng)域進(jìn)行深入分析,才能破譯生命密碼,近期,曙光成功中標(biāo)上海生科院生物“醫(yī)學(xué)大數(shù)據(jù)設(shè)施-信息系統(tǒng)基礎(chǔ)平臺(tái)”項(xiàng)目,助力上海生科院在生命科學(xué)研究、生物醫(yī)藥研發(fā)、臨床醫(yī)學(xué)研究與應(yīng)用的發(fā)展。

生物醫(yī)學(xué)大數(shù)據(jù)基礎(chǔ)設(shè)施深刻體現(xiàn)前沿信息技術(shù)與現(xiàn)代生命科學(xué)的高度交叉,采用大規(guī)模存儲(chǔ)為底層架構(gòu),以海量生物醫(yī)學(xué)大數(shù)據(jù)資源的高等級(jí)安全保藏為核心,實(shí)施生物醫(yī)學(xué)大數(shù)據(jù)資源的匯聚、管理、共享和挖掘,形成服務(wù)于全國(guó)的生物醫(yī)學(xué)大數(shù)據(jù)研究與應(yīng)用的重大與關(guān)鍵技術(shù)條件設(shè)施。

滿足復(fù)雜運(yùn)算需求,曙光ParaStor為“生物信息”提供高可靠平臺(tái)

曙光憑借多年在生物基因領(lǐng)域積累的經(jīng)驗(yàn),打造生物基因行業(yè)云存儲(chǔ)解決方案,助力“生命科學(xué)”探索。曙光分布式存儲(chǔ)系統(tǒng)ParaStor更是憑借先進(jìn)的應(yīng)用匹配性與超高性能,贏得了市場(chǎng)的認(rèn)可。

此次,曙光助力上海生科院生物“醫(yī)學(xué)大數(shù)據(jù)設(shè)施-信息系統(tǒng)基礎(chǔ)平臺(tái)”項(xiàng)目,將建設(shè)一個(gè)面向生命科學(xué)研究、生物醫(yī)藥研發(fā)、臨床醫(yī)學(xué)研究與應(yīng)用,推動(dòng)生物醫(yī)藥技術(shù)企業(yè)創(chuàng)新發(fā)展,以共享式服務(wù)為導(dǎo)向的科學(xué)技術(shù)綜合體。

曙光以ParaStor構(gòu)建的大規(guī)模存儲(chǔ)系統(tǒng),以海量生物醫(yī)學(xué)大數(shù)據(jù)資源的高等級(jí)安全保藏為核心,支撐高通量專業(yè)云計(jì)算服務(wù)和大數(shù)據(jù)人工智能挖掘。實(shí)現(xiàn)生物醫(yī)學(xué)大數(shù)據(jù)資源的匯聚、管理、共享和挖掘,成為面向全社會(huì)的生物醫(yī)學(xué)大數(shù)據(jù)標(biāo)準(zhǔn)化整合、安全管理、高效共享的存儲(chǔ)中心。

存儲(chǔ)系統(tǒng)作為重要的基礎(chǔ)架構(gòu),在本次項(xiàng)目中有著極為嚴(yán)苛的要求。生物醫(yī)學(xué)數(shù)據(jù)的主要類型為文本文件、圖像文件、二進(jìn)制文件等非結(jié)構(gòu)化數(shù)據(jù),對(duì)存儲(chǔ)的要求主要在存儲(chǔ)容量的大小和大文件的讀寫通量的高低,而少量的關(guān)鍵數(shù)據(jù)庫、索引等結(jié)構(gòu)化數(shù)據(jù),對(duì)存儲(chǔ)的要求是較高 IOPS 和穩(wěn)定的讀寫能力。對(duì)存儲(chǔ)系統(tǒng)的需求可總結(jié)為:業(yè)務(wù)系統(tǒng)存儲(chǔ)、高性能存儲(chǔ)和大容量存儲(chǔ)。

曙光ParaStor通過Scale-Out橫向擴(kuò)展、IB+RDMA高速互聯(lián)、內(nèi)核態(tài)POSIX協(xié)議、智能SSD Cache及小文件聚合等技術(shù),消除傳統(tǒng)的Scale-up縱向擴(kuò)展存儲(chǔ)架構(gòu)的性能局限性,解決生物基因應(yīng)用中對(duì)海量大文件存儲(chǔ)場(chǎng)景高聚合帶寬、小文件存儲(chǔ)場(chǎng)景高IOPS的存儲(chǔ)需求。

ParaStor分布式存儲(chǔ)系統(tǒng)可通過性能與容量的線性增長(zhǎng),滿足對(duì)存儲(chǔ)系統(tǒng)數(shù)據(jù)處理能力和擴(kuò)展性的要求。此外,針對(duì)業(yè)務(wù)系統(tǒng)對(duì)可靠性、穩(wěn)定性的需求,ParaStor分布式存儲(chǔ)系統(tǒng)通過多種技術(shù)手段,從物理底層到邏輯層全方位保證存儲(chǔ)系統(tǒng)高可靠性和高可用性。豐富的協(xié)議接口,多類型數(shù)據(jù)融合存儲(chǔ),可以保證多業(yè)務(wù)共享。

曙光生物基因行業(yè)云存儲(chǔ)解決方案廣泛運(yùn)用于生命科學(xué)領(lǐng)域,也為廣大客戶的業(yè)務(wù)提供了有效的性能保障和技術(shù)支持。在天壇醫(yī)院面向高通量基因組學(xué)數(shù)據(jù)處理與智能病理影像識(shí)別系統(tǒng)項(xiàng)目中,ParaStor通過超高吞吐性能大幅度提高了面向測(cè)序數(shù)據(jù)及影像數(shù)據(jù)科研質(zhì)量、縮短科研周期、降低科研成本。與第二代基因測(cè)試儀illumina、主流應(yīng)用軟件長(zhǎng)期對(duì)接測(cè)試與優(yōu)化是曙光扎根于該領(lǐng)域的基礎(chǔ),ParaStor對(duì)于生物信息復(fù)雜應(yīng)用軟件的優(yōu)質(zhì)適配以及均衡穩(wěn)定的性能表現(xiàn)給某國(guó)家醫(yī)療大數(shù)據(jù)中心客戶留下了深刻的印象。

消息來源:中科曙光
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