冰島雷克雅未克2021年12月3日 /美通社/ -- 在今天發(fā)表于《自然-遺傳學(xué)》(Nature genetics)的一項(xiàng)研究報(bào)告中,制藥公司Amgen下屬子公司deCODE genetics的科學(xué)家展示了在結(jié)合序列多樣性和RNA表達(dá)的數(shù)據(jù)時(shí),對(duì)血漿中大量蛋白質(zhì)的水平進(jìn)行人群規(guī)模測(cè)量如何能夠顯著提高對(duì)人類疾病和其他表型的認(rèn)識(shí)。
deCODE genetics的科學(xué)家在人群規(guī)模的多重平臺(tái)上運(yùn)用5000種蛋白質(zhì)的血漿蛋白水平,以揭示其遺傳決定因素及其與人類疾病和其他特征的關(guān)系。與今天發(fā)布的研究報(bào)告相比,此前的蛋白質(zhì)水平遺傳學(xué)研究在研究目標(biāo)個(gè)體數(shù)量或所檢測(cè)的蛋白質(zhì)數(shù)量方面都要小得多。
deCODE genetics的科學(xué)家利用Somascan蛋白質(zhì)組學(xué)分析測(cè)定血漿中的蛋白質(zhì)水平,針對(duì)35559名冰島人檢測(cè)了2700萬個(gè)序列變異與4719種蛋白質(zhì)的血漿蛋白水平的關(guān)聯(lián)。他們?cè)谛蛄凶儺惡偷鞍踪|(zhì)水平之間發(fā)現(xiàn)了18084項(xiàng)關(guān)聯(lián),其中19%發(fā)生于全基因組測(cè)序識(shí)別出的罕見變異。總體而言,其中93%均為新關(guān)聯(lián)。此外,他們還分別根據(jù)Somascan方法和抗體Olink分析復(fù)制了現(xiàn)有最大規(guī)模血漿蛋白質(zhì)組學(xué)研究中83%和64%的關(guān)聯(lián)。
他們針對(duì)373種疾病和其他特征對(duì)血漿中蛋白質(zhì)水平進(jìn)行了關(guān)聯(lián)測(cè)試,得到257490種此類關(guān)聯(lián)。他們將序列變異與蛋白質(zhì)水平、疾病和其他特征的關(guān)聯(lián)進(jìn)行整合,并發(fā)現(xiàn)所報(bào)告的大約5萬個(gè)變異中有12%與疾病相關(guān)聯(lián),其他特征也與蛋白質(zhì)水平相關(guān)。
deCODE genetics首席執(zhí)行官、本論文高級(jí)作者之一Kari Stefansson表示:“蛋白質(zhì)組學(xué)可以幫助解決基因研究中的一個(gè)主要挑戰(zhàn):確定哪些基因造成了疾病的序列變異影響。此外,血液中的蛋白質(zhì)水平會(huì)隨不同事件的時(shí)間而上升和下降,因此蛋白質(zhì)組還提供了時(shí)間上的某種度量。”
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