深圳2021年7月30日 /美通社/ -- 2021年7月13日，經科技部批準成立的第三方專業(yè)科技成果評價機構中科合創(chuàng)（北京）科技成果評價中心，組織專家以視頻連線方式召開了科技成果評價會，對承啟張弓教授團隊完成的“全自主高性能高穩(wěn)健的核酸測序快速比對算法及云分析系統(tǒng)”進行科技評價。經過專家評審，FANSe系列算法同時達到了極高計算速度與準確性的雙重目標，具有超強的容錯能力及遠超傳統(tǒng)算法的實驗可驗證性，在解決“精準醫(yī)學不精準”的世界性難題上做出了重要的貢獻。作為可商用的基因數據底層比對核心技術，其比對精度比歐美算法高出兩個數量級，其云平臺的投入應用得到了用戶的一致好評，體現出良好的商業(yè)效益和社會效益。FANSe系列算法完全自主研發(fā)，保障了中國的科研和精準醫(yī)學的獨立自主性。評價專家組一致認為，該項目具有很強的科學性、創(chuàng)新性和實用性，研究成果總體上達到國際領先水平。
這是國家權威機構對FANSe的“官方認證”。
FANSe算法科技成果通過中科合創(chuàng)(北京)科技成果評價中心評價
目前，幾乎所有二代測序應用需要進行mapping（快速比對），鑒于所有生物學意義的分析都高度依賴于mapping的結果，尤其是存在于reads（短讀序列）中的錯配結果，因此mapping的速度和精度都很重要。但速度與精度通常不可兼得，比如基于BWT原理的算法速度提升，但對錯配的處理無法做到完美，在實際生物學應用中容易導致假陰性和假陽性問題，國際頂級科學雜志Nature斥之為“可重復性危機”（2012年）。2017年，JAMA Oncology雜志發(fā)布結果，將40份癌癥病人樣本送給兩家世界知名測序公司進行測序，絕大部分樣本的兩份突變報告完全不同。因此二代測序技術在臨床上亂象叢生，難以保證高通量下的準確性。
為此，張弓教授開始研發(fā)FANSe算法，力圖建立穩(wěn)健精準的二代測序基礎技術。2011年，FANSe1代研發(fā)成功，奠定了準確穩(wěn)健的數學基礎，錯誤率可低至10-9以下，一定條件之下可以100%保證得到數學最優(yōu)解；2014年，FANSe2代研發(fā)成功，實現了并行化處理，同年開始部署在承啟生物的云平臺上；2015年起，高性能的FANSe3開始研發(fā)，2017年開始在國際權威科學期刊上亮相，2018年首次實現了單機1小時全基因組、1秒鐘全轉錄組的驚人分析速度；2020年，云平臺專用的FANSe4代在承啟生物創(chuàng)造了單節(jié)點5分鐘分析完一個人全基因組測序數據集的新紀錄。由于其強悍的性能和全自主的特點，FANSe被作為科技部國家重點研發(fā)計劃《醫(yī)學生命組學數據質量控制關鍵技術研發(fā)與應用》核酸測序的底層算法，為組學領域的質控標準貢獻關鍵力量。
