上海2022年4月13日 /美通社/ -- 人工智能(AI)、生物計算技術正賦能生命科學領域的研究,加速新藥研發(fā)的進程。mRNA平臺技術在新冠疫苗的研發(fā)中脫穎而出,兩款新冠mRNA疫苗的上市也預示著這項前沿技術將對生物醫(yī)藥行業(yè)產(chǎn)生顛覆性影響。隨著人工智能技術與生物、醫(yī)藥等行業(yè)深度融合,mRNA技術在AI賦能下將迎來更加蓬勃的發(fā)展。
此前,百度研究院與斯微(上海)生物科技股份有限責任公司(以下簡稱斯微生物)就新冠mRNA疫苗的開發(fā)展開了AI序列優(yōu)化算法的合作,開發(fā)了專門用于設計優(yōu)化mRNA序列的高效算法。該算法將自然語言處理領域中的"word lattice parsing"概念拓展到計算生物領域,能夠迅速設計出更穩(wěn)定更有效的新冠疫苗序列。
斯微生物完成了這種高效算法在新冠病毒mRNA疫苗分子設計上的生物學驗證。結果顯示,在穩(wěn)定性、蛋白質(zhì)表達水平以及免疫原性等多個衡量疫苗的重要指標上,通過這種算法設計的新冠疫苗序列優(yōu)于傳統(tǒng)方法設計的基準序列;疫苗序列中和抗體滴度(疫苗最重要的指標之一)是傳統(tǒng)基準序列的20倍。除了新冠mRNA疫苗之外,該算法適用于包括傳染病、腫瘤以及罕見病在內(nèi)的各種mRNA疫苗或藥物序列的優(yōu)化設計。
日前,斯微生物與百度研究院再度攜手,雙方將在現(xiàn)有算法基礎上進一步提升,除了擴大線性mRNA算法優(yōu)化研究,雙方將嘗試開展環(huán)狀RNA等序列設計迭代技術的開發(fā),通過提升mRNA的穩(wěn)定性和翻譯效率來提高抗原蛋白的表達量及持續(xù)時間,有望將mRNA的優(yōu)勢更加充分的體現(xiàn),即提高效率,提升安全性,降低生產(chǎn)成本。
斯微生物創(chuàng)始人兼CEO李航文博士表示:
將AI技術應用于生物制藥領域有利于打造交叉學科的藥物研發(fā)平臺,有利于源頭創(chuàng)新。以AI進行mRNA序列優(yōu)化能夠幫助mRNA更穩(wěn)定地表達出更多的蛋白。針對新冠病毒mRNA疫苗,相關算法10分鐘就設計出即穩(wěn)定和蛋白質(zhì)表達水平又高的疫苗分子,從而有效解決了mRNA疫苗研發(fā)中穩(wěn)定性這一難題,加快疫苗研發(fā)速度。我們與百度AI算法的聯(lián)合也將為我們在研管線和RNA平臺帶來更大的提升,有望推出更多best-in-class的產(chǎn)品。
此次斯微生物攜手百度研究院把研究領域拓展到環(huán)狀RNA,將在增加mRNA的穩(wěn)定性和翻譯效率的同時,增加藥物和疫苗的安全性。環(huán)狀mRNA是RNA研究最熱、最前沿的領域。雙方的合作開辟了新領域,是創(chuàng)新的嘗試。他認為,相比線性mRNA,環(huán)狀mRNA更穩(wěn)定,在體內(nèi)持續(xù)作用時間大大加長,同時以環(huán)狀mRNA技術研發(fā)的藥物性能將更為優(yōu)越,用藥周期將被延長,有利于提升患者接受規(guī)范治療的依從性和方便性,未來應用前景廣闊。
美國羅切斯特大學David Mathews教授評價,相關算法設計了一組結構更穩(wěn)定的序列,并使用優(yōu)化的密碼子。此算法高效的運行速度是優(yōu)化序列設計的關鍵,這些序列可以通過實驗檢驗它們作為疫苗和藥物的效果。
mRNA疫苗的研發(fā)和生產(chǎn)是涉及到多項關鍵卡脖子技術,斯微在每個技術平臺上都進行自研或與國內(nèi)外頂尖機構進行合作。此次與百度的合作,具有引領國內(nèi)mRNA技術趕超世界水平的重要戰(zhàn)略意義。作為頭部mRNA疫苗及藥物研發(fā)企業(yè),兩家的強強合作能夠帶動mRNA的研發(fā)與整體產(chǎn)業(yè)的發(fā)展。