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西交利物浦大學(xué)團(tuán)隊(duì)繪制出精確M6A表觀轉(zhuǎn)錄組地圖

蘇州2019年3月22日 /美通社/ -- 來自西交利物浦大學(xué)的研究人員已完成對(duì)全轉(zhuǎn)錄組m6A RNA修飾的高分辨率預(yù)測(cè),成功繪制了精準(zhǔn)的m6A表觀轉(zhuǎn)錄組地圖。

這項(xiàng)由生物科學(xué)系孟佳博士帶領(lǐng)的研究已于近日發(fā)表在《核酸研究》上。

孟博士表示,研究結(jié)果可能會(huì)給許多疾病帶來希望。

他說:“很難預(yù)測(cè)哪些疾病會(huì)從m6A RNA甲基化研究中受益,但研究表明m6A RNA甲基化酶在白血病、肺癌和乳腺癌中發(fā)揮著關(guān)鍵作用。

“作為基因調(diào)控的基礎(chǔ)層,通過可逆m6A RNA甲基化進(jìn)行的表觀轉(zhuǎn)錄組調(diào)控在許多疾病中起著重要作用并不足為奇。

“經(jīng)證明,癌癥是有望進(jìn)一步探索的方向?!?/p>

孟博士表示,RNA代表核糖核酸(被稱為DNA的“表親”),m6A RNA修飾是一種發(fā)生在RNA分子上的生物化學(xué)修飾,可以在不改變RNA分子序列信息的情況下改變其生物學(xué)特性,并調(diào)控基因表達(dá)。

他說:“過去運(yùn)用傳統(tǒng)的序列信息,m6A RNA修飾位點(diǎn)預(yù)測(cè)的準(zhǔn)確率只能達(dá)到80%左右。

“我們發(fā)現(xiàn),通過加入35種組學(xué)特征,我們可以將準(zhǔn)確率提高到90%,這是一個(gè)比較大的突破?!?/p>

孟博士稱,這是當(dāng)今生物科學(xué)領(lǐng)域的一個(gè)熱門話題,有100多種不同類型的RNA修飾,而它們的功能大多仍是未知數(shù)。

孟博士說,m6A是較豐富的一種修飾,可能也是較具研究?jī)r(jià)值的。

在繪制m6A表觀轉(zhuǎn)錄組地圖的過程中,研究團(tuán)隊(duì)運(yùn)用機(jī)器學(xué)習(xí)的技術(shù),根據(jù)傳統(tǒng)的序列特征和新的組學(xué)特征建立了預(yù)測(cè)模型,準(zhǔn)確預(yù)測(cè)基因的哪些位置可能與m6A RNA修飾相關(guān)。

博士生陳鯤淇表示,實(shí)現(xiàn)更準(zhǔn)確的預(yù)測(cè),并且更好地了解m6A RNA修飾的位點(diǎn),可使科學(xué)家更容易確定哪些酶會(huì)參與到這個(gè)過程中來。

他說:“我們的工作對(duì)進(jìn)一步研究基因的功能、性狀及其與人類某些疾病的關(guān)系有一定的價(jià)值?!?/p>

消息來源:西交利物浦大學(xué)
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